Python协方差与相关系数怎么定义
本篇内容介绍了“Python协方差与相关系数怎么定义”的有关知识,在实际案例的操作过程中,不少人都会遇到这样的困境,接下来就让小编带领大家学习一下如何处理这些情况吧!希望大家仔细阅读,能够学有所成!
联合分布中包含了相当丰富的信息。比如从联合分布中抽取某个随机变量的边缘分布,即获得该随机变量的分布,并可以据此,获得该随机变量的期望和方差。这样做是将视线限制在单一的一个随机变量上,我们损失了联合分布中包含的其他有用信息,比如不同随机变量之间的互动关系。为了了解不同随机变量之间的关系,需要求助其它的一些描述量。
协方差
协方差(covariance)表达了两个随机变量的协同变化关系。我们取一个样本空间,即学生的体检数据。学生的身高为随机变量X,学生的体重为随机变量Y。
160cm | 170cm | 180cm | |
60kg | 0.2 | 0.05 | 0.05 |
70kg | 0.05 | 0.3 | 0.05 |
80kg | 0.05 | 0.05 | 0.2 |
根据上表,大的身高(180cm)和大的体重(80kg)同时出现的概率较大(0.2),小的身高值(160cm)和小的体重(60kg)的概率也较大(0.2)。偏大的身高往往伴随偏大的体重,偏小的身高常伴随偏小的体重。这种“大”伴随着“大”,“小”伴随着“小”的情形,叫做正相关。根据上面的数据,身高和体重两个随机变量正相关性很强。
另一方面,如果“大”配“小”,“小”配“大”的概率很高,那么两个随机变量负相关。“最萌身高差”是负相关的一个范例。(样本空间为情侣的身高信息。可以定义男生身高为一个随机变量,女生身高为另一个随机变量)
正如其他的分布描述量一样,协方差从概率分布中提取信息,让我们获知分布的“性能”。对于一个已知的联合分布来说,任意两个随机变量之间都可以计算出一个协方差,即一个数值。
定义
协方差的定义如下,如果X和Y是联合分布的随机变量,且分别有期望μXμX,μYμY,那么X和Y的协方差为
Cov(X,Y)=E[(X−μX)(Y−μY)]Cov(X,Y)=E[(X−μX)(Y−μY)]
协方差的定义基于期望。根据期望的定义,协方差可以直接用于离散随机变量和连续随机变量。
我们已经知道,期望是某个随机变量根据概率的加权平均。我们所要加权平均的目标是X−μXX−μX和Y−μYY−μY的乘积。随机变量和期望的差,代表了随机变量的取值和中心值的偏离程度,也就是我们上面所谓的“偏大”或者“偏小”的情况:正值的偏离表示“偏大”,负值的偏离表示“偏小”。如果是正相关,即大配大,小配小的情况,那么这一乘积为正;如果是负相关,乘积为负。所以,通过(X−μX)(Y−μY)(X−μX)(Y−μY)这个量,我们表达了X和Y的相关性。
回到刚才的数据来计算相关性,
160cm | 170cm | 180cm | |
60kg | 0.2 | 0.05 | 0.05 |
70kg | 0.05 | 0.3 | 0.05 |
80kg | 0.05 | 0.05 | 0.2 |
让身高为X,体重为Y。我们可以通过边缘分布,来分别获得X和Y的分布(回忆一下)。求得X和Y的期望,分别为170和70。计算各个格子中的(X−μX)(Y−μY)(X−μX)(Y−μY)
160cm | 170cm | 180cm | |
60kg | 100 | 0 | -100 |
70kg | 0 | 0 | 0 |
80kg | -100 | 0 | 100 |
上面的两个表,对应的格子相乘,并求和,就得到协方差:
Cov(X,Y)=0.2×100+0.2×100+0.05×(−100)+0.05×(−100)=30(1)(2)(1)Cov(X,Y)=0.2×100+0.2×100+0.05×(−100)+0.05×(−100)(2)=30
在上面的计算中,正相关的项目都分配有比较大的概率值。最终的协方差也是一个正值。
根据期望的性质,我们可以改写协方差的表达形式:
Cov(X,Y)=E(XY−XμX−YμX+μXμY)=E(XY)−E(X)μX−E(Y)μY+μXμY=E(XY)−E(X)E(Y)(3)(4)(5)(3)Cov(X,Y)=E(XY−XμX−YμX+μXμY)(4)=E(XY)−E(X)μX−E(Y)μY+μXμY(5)=E(XY)−E(X)E(Y)
当X和Y独立时,有E(XY)=E(X)E(Y)E(XY)=E(X)E(Y),Cov(X,Y)=0Cov(X,Y)=0。
(注意,Cov(X,Y)=0Cov(X,Y)=0并不意味着X和Y独立)
相关系数
正的协方差表达了正相关性,负的协方差表达了负相关性。对于同样的两个随机变量来说,计算出的协方差越大,相关性越强。
但随后一个问题,身高和体重的协方差为30,这究竟是多大的一个量呢?如果我们又发现,身高与鞋号的协方差为5,是否说明,相对于鞋号,身高与体重的的相关性更强呢?
这样横向对比超出了协方差的能力范围。从日常生活经验来说,体重的上下浮动大约为20kg,而鞋号的上下浮动大约可能只是5个号码。所以,对于体重来说,5kg与中心的偏离并不算大,而5个号码的鞋号差距,就可能是最极端的情况了。假设身高和体重的相关强度,与身高和鞋码的相关强度类似,但由于体重本身的数值上下浮动更大,所计算出的协方差也会更大。另一个情况,依然是计算身高与体重的协方差。数据完全不变,而只更改单位。我们的体重用克而不是千克做单位,计算出的协防差是原来数值的1000倍!
为了能进行这样的横向对比,我们需要排除用统一的方式来定量某个随机变量的上下浮动。这时,我们计算相关系数(correlation coefficient)。相关系数是“归一化”的协方差。它的定义如下:
ρ=Cov(X,Y)Var(X)Var(Y)−−−−−−−−−−−−√ρ=Cov(X,Y)Var(X)Var(Y)
相关系数是用协方差除以两个随机变量的标准差。相关系数的大小在-1和1之间变化。再也不会出现因为计量单位变化,而数值暴涨的情况了。
依然使用上面的身高和体重数据,可以计算出
Var(X)=0.3×(60−70)2+0.3×(80−70)2=60Var(X)=0.3×(60−70)2+0.3×(80−70)2=60
Var(Y)=0.3×(180−170)2+0.3×(160−170)2=60Var(Y)=0.3×(180−170)2+0.3×(160−170)2=60
ρ=30/60=0.5ρ=30/60=0.5
这样一个“归一化”了的相关系数,更容易让人把握到相关性的强弱,也更容易在不同随机变量之间,做相关性的横向比较。
双变量正态分布
双变量正态分布是一种常见的联合分布。它描述了两个随机变量X1X1和X2X2的概率分布。概率密度的表达式如下:
f(x1,x2)=12πσ1σ21−ρ2−−−−−√exp[−z2(1−ρ2)]f(x1,x2)=12πσ1σ21−ρ2exp[−z2(1−ρ2)]
其中,
z=(x1−μ1)2σ21−2ρ(x1−μ1)(x2−μ2)σ1σ2+(x2−μ2)2σ22z=(x1−μ1)2σ12−2ρ(x1−μ1)(x2−μ2)σ1σ2+(x2−μ2)2σ22
X1X1和X2X2的边缘密度分别为两个正态分布,即正态分布N(μ1,σ1)N(μ1,σ1), N(μ2,σ2)N(μ2,σ2)。
另一方面,除非ρ=0ρ=0,否则联合分布也并不是两个正态分布的简单相乘。可以证明,ρρ正是双变量正态分布中,两个变量的相关系数。
我们现在绘制该分布的图像。可惜的是,现在的scipy.stats并没有该分布。我们需要自行编写。
选取所要绘制的正态分布,为了简单起见,让μ1=0μ1=0, μ2=0μ2=0, σ1=1σ1=1,σ2=1σ2=1。
我们先让ρ=0ρ=0,此时的联合分布相当于两个正态分布的乘积。绘制不同视角的同一分布,结果如下。可以看到,概率分布是中心对称的。
再让ρ=0.8ρ=0.8,也就是说,两个随机变量的相关系数为0.8。绘制不同视角的同一分布,结果如下。可以看到,概率分布并不中心对称。沿着Y=XY=X这条线,概率曲面隆起,概率明显比较高。而沿着Y=−XY=−X这条线,概率较低。这也就是我们所说的正相关。
现在,ρρ对于我们来说,有了更具体的现实意义。:-)
# By Vameifrom scipy.stats import normimport numpy as np# this function is to generate a pdf of bivariate normal distributiondef bivar_norm(mu1, mu2, sigma1, sigma2, rho): # pdf of bivariate norm def pdf(x1, x2): # get z part1 = (x1 - mu1)**2/sigma1**2 part2 = - 2.*rho*(x1 - mu1)*(x2 - mu2)/sigma1*sigma2 part3 = (x2 - mu2)**2/sigma2**2 z = part1 + part2 + part3 cof = 1./(2.*np.pi*sigma1*sigma2*np.sqrt(1 - rho**2)) return cof*np.exp(-z/(2.*(1 - rho**2))) return pdf pdf1 = bivar_norm(0, 0, 1, 1, 0) pdf2 = bivar_norm(0, 0, 1, 1, 0.8)from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3Dfrom matplotlib import cmfrom matplotlib.ticker import LinearLocator, FormatStrFormatterimport matplotlib.pyplot as plt# plot functiondef space_surface(pdf, xp, yp, zlim, rot1=30, rot2=30): fig = plt.figure() ax = fig.gca(projection='3d') X = np.arange(*xp) Y = np.arange(*yp) X, Y = np.meshgrid(X, Y) Z = pdf(X, Y) surf = ax.plot_surface(X, Y, Z, rstride=8, cstride=8, alpha = 0.3) cset = ax.contour(X, Y, Z, zdir='z', offset=zlim[0], cmap=cm.coolwarm) cset = ax.contourf(X, Y, Z, zdir='x', offset=xp[0], cmap=cm.coolwarm) cset = ax.contourf(X, Y, Z, zdir='y', offset=yp[0], cmap=cm.coolwarm) for angle in range(rot1 + 0, rot1 + 360): ax.view_init(rot2, angle) ax.set_zlim(*zlim) ax.zaxis.set_major_locator(LinearLocator(10)) ax.zaxis.set_major_formatter(FormatStrFormatter('%.02f')) ax.set_xlabel("X") ax.set_ylabel("Y") ax.set_zlabel("f(x,y)") # fig.colorbar(surf, shrink=0.5, aspect=5)xp = [-3, 3, 0.05] yp = [-3, 3, 0.05] zlim1 = [-0.15, 0.15] zlim2 = [-0.25, 0.25] space_surface(pdf1, xp, yp, zlim1, 30, 20) space_surface(pdf1, xp, yp, zlim1, 60, 45) space_surface(pdf2, xp, yp, zlim2, 30, 20) space_surface(pdf2, xp, yp, zlim2, 60, 45)
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